在自然生殖状态下，婚姻与生育是匹配的，父亲、母亲、子女之间关系明确，子女的生物学上父母与其社会学父母是吻合的。从生物学上，父母与子女有生物遗传关系；从社会学上，父母与子女有法定的母子、父子关系，互相承担抚养和赡养责任和义务。但由于辅助生殖技术打破了传统生育与遗传的统一性，可将不同来源的精子、卵子、子宫进行组合而产生子女，最多可能产生五位父母，即生物学父亲（遗传父亲）、社会学父亲（养育父亲）、妊娠母亲（代孕母亲）、生物学母亲（遗传母亲）和社会学母亲（养育母亲）。导致子女的生物学父母与其社会学父母不吻合，父母与子女间关系复杂，对亲子鉴定及个人识别产生影响。
（一）“配偶试管婴儿”对亲子鉴定影响。
体外受精———胚胎移植技术（IVF-ET）中，取出妻子的卵子，与丈夫的精子在体外受精后，将受精培养成胚胎，移植在妻子子宫内，而妊娠生育。辅助生殖时，丈夫供精子，妻子供卵子，妻子妊娠、分娩。产生的子女在承接父母的遗传基因上，与自然生殖产生的子女无差异。供卵子者、妊娠分娩者与养育母亲是同一位女性；供精子者与养育父亲是同一位男性。子女的生物学父母与其社会学父母是吻合的，因而对亲子鉴定不会产生影响，亲子鉴定按照常规鉴定方法进行鉴定。另外在人工授精技术中，用人工方法将丈夫的精子置于妻子生殖道内，与妻子的卵子结合，而妊娠生育，也不会对亲子鉴定产生影响。
（二）“借精子试管婴儿”对亲子鉴定影响。
如果丈夫因病没有精子或因有遗传病而不能提供精子，这样就得用精子库中他人的精子（捐精者）与其妻子的卵子在体外受精后，将受精卵培养成胚胎，移植在妻子的子宫内，而妊娠产生———“借精子试管婴儿”。供卵子者、妊娠分娩者与养育母亲是同一位女性；供精子者与养育父亲分离，不是同一位男性。因此，子女的生物学母亲与其社会学母亲吻合，而子女的生物学父亲与其社会学父亲不吻合。子女体内来自父亲的遗传基因是捐精者的，而捐精者情况一般是保密的。因此，亲子鉴定一般只做母子的单亲鉴定，或鉴定个体的母系血缘关系，确定是否存在血缘关系，达到个人识别目的。如果需要鉴定父系的血缘关系（生物学父亲），就必须从医院等方面，调查捐精者个人信息，才能进行分析鉴定。此外在人工授精技术中，将捐精者提供的精子置于妻子生殖道内，与妻子的卵子结合，而妊娠生育，其对亲子鉴定产生影响则相同。
（三）“借卵试管婴儿”对亲子鉴定影响。
妻子因病没有卵子或因有遗传病而不能提供卵子，这样就得用他人的卵子（捐卵者）与其丈夫的精子在体外受精后，将受精卵培养成胚胎，移植在妻子的子宫内,而妊娠产生———“借卵试管婴儿”。供精子者与养育父亲是同一位男性；供卵子者与妊娠分娩者及养育母亲分离，不是同一位女性。因而子女的生物学父亲与其社会学父亲吻合，而子女的生物学母亲与其社会学母亲不吻合。子女体内来自母亲的遗传基因是捐卵者的，而捐卵者情况一般是保密的。因此，亲子鉴定一般只做父子的单亲鉴定，或鉴定父系的血缘关系。如果需要鉴定母系的血缘关系（生物学母亲），就必须从医院等方面，调查捐卵者个人信息，才能进行分析鉴定。
丈夫供精子，妻子供卵子，用卵浆置换技术将妻子的卵子内的卵浆同另一女性（捐卵浆者）的健康卵浆置换，然后与丈夫的精子在体外结合，形成受精卵后移入子宫内，生长发育成胎儿。采用“卵浆置换”后，卵细胞核仍代表妻子的遗传特征，鉴定细胞核DNA时，与自然生殖产生的子女无差异。但是卵浆的遗传信息则为捐卵浆者的。卵浆置换技术生产的孩子在鉴定时，应注意如鉴定其细胞内mt DNA时，遗传基因不是生母的，而是捐卵浆的女性的。需要调查捐卵浆者个人信息，才能进行分析鉴定。
（四）“借腹代孕试管婴儿”对亲子鉴定影响。
妻子做了子宫切除术后，或尽管夫妇双方无生育问题，但既想要自己的孩子，又不想孕育孩子（不愿承受分娩的痛苦、怕破坏体型等），或者因病子宫无孕育能力。因此，采取父亲供精子，母亲供卵子，在体外受精后，将受精卵培养成胚胎，植入其他女性的子宫内孕育，而妊娠产生———“借腹代孕试管婴儿”。自然生殖时，妊娠分娩者必然是孩子的生物学母亲。但代孕打破了这种自然规律，妊娠分娩者可以不是孩子的生物学母亲，而是代孕母亲。因而“借腹代孕试管婴儿”的母亲分为生物学母亲（供卵子者）、妊娠母亲（供子宫，妊娠分娩者）和社会学母亲（养育者）。使亲子鉴定变得复杂化，给鉴定带来困难。根据精子、卵子、子宫来源情况，可形成不同的代孕形式，而对亲子鉴定产生不同的影响。
由于技术上还存在问题、加之社会各界的反对等原因，目前还没有“克隆试管婴儿”诞生。假如“克隆试管婴儿”出现，由于其遗传基因完全来自提供细胞核的捐核者的，将其为捐核者的复制体或为有年龄差的孪生兄弟姐妹。亲子鉴定一般与捐核者及其有血缘关系的亲属进行鉴定。另外与卵浆置换技术生产的试管婴儿一样，其细胞内mt DNA，是来自捐卵浆的女性的。
